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大則不同：基因組擴張有助于植物適應熱帶環(huán)境

結(jié)果表明，蔊菜基因組大小存在連續(xù)的種內(nèi)自然變異，且與地理分布、氣候梯度和譜系歷史等顯著相關(guān)：相較于北方溫帶譜系，熱帶譜系普遍擁有更大的基因組?；蚪M重復序列量化分析揭示，上述差異主要由45S rDNA和Ty1反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子等特定重復序列的擴增所驅(qū)動。同質(zhì)園實驗將不同基因組大小的株系分別移植至西雙版納（熱帶）和昆明（溫帶），結(jié)果顯示：在溫度穩(wěn)定的熱帶環(huán)境中，大基因組株系結(jié)實量更高，適應優(yōu)勢顯著。

氣溫和飽和水汽壓差在植被生態(tài)系統(tǒng)生產(chǎn)力中扮演的角色

研究結(jié)果表明，VPD對植被生產(chǎn)力表現(xiàn)出顯著的負效應（尤其在干旱和半干旱地區(qū)），而氣溫在排除交互作用后總體呈現(xiàn)正效應，但當高溫與高VPD協(xié)同發(fā)生時，氣溫的正向效應會被顯著削弱；基于CMIP6多模式集合的預測進一步顯示，未來VPD的負面效應將持續(xù)增強，氣溫的正效應將逐漸減弱，這種變化在中緯度地區(qū)表現(xiàn)最為顯著。該研究不僅系統(tǒng)揭示了VPD在調(diào)控陸地生態(tài)系統(tǒng)功能中的關(guān)鍵作用，為理解氣候變化下植被響應機制提供了新的理論依據(jù)，更重要的是發(fā)現(xiàn)了溫度-VPD協(xié)同效應機制，這一創(chuàng)新發(fā)現(xiàn)既為解釋植被生產(chǎn)力響應區(qū)域差異提供了新視角，也為未來生態(tài)系統(tǒng)管理、碳循環(huán)預測及植被適應策略制定提供了重要科學參考。

夾竹桃科植物系統(tǒng)發(fā)育框架與多樣性演化歷史研究取得新進展

系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果顯示大多數(shù)節(jié)點都獲得較高的支持率，3個亞科（馬利筋亞科 Asclepiadoideae、鯽魚藤亞科Secamonoideae、杠柳亞科 Periplocoideae）被強烈支持為單系群（BS=100，PP=1.00），其中馬利筋亞科與鯽魚藤亞科構(gòu)成姐妹群，杠柳亞科嵌入在Apocynoid類群中，與Endress等（2019）的分類系統(tǒng)一致.

熱帶地區(qū)附生維管植物的氮同位素分餾：氮限制實證及驅(qū)動因素

結(jié)果表明：1）附生維管植物葉-根間15N分餾效應（+0.43‰）較小，與地生植物（2‰）相比，反映了森林冠層比地面生境存在更嚴重的N限制；2）附生植物的葉-根15N分餾在不同分組間保持相對一致，但具有顯著的物種特異性，且與系統(tǒng)發(fā)育無顯著相關(guān)，反映了外部N源及其N獲取策略的綜合影響；3）附生植物的葉-根15N正分餾主要與葉片N、根C相關(guān)，而負分餾與葉片δ13C相關(guān)，暗示不同因素（如外部氮源、水分虧缺和氮獲取策略）驅(qū)動著其體內(nèi)15N分餾過程。

鳥類-植物互作網(wǎng)絡(luò)的系統(tǒng)發(fā)育效應取得新進展

研究發(fā)現(xiàn)，互作伙伴數(shù)量的系統(tǒng)發(fā)育信號在鳥類和植物中均較弱，表明互作伙伴數(shù)量更多受其他因素（如表型特征）驅(qū)動。然而，在互作伙伴的物種組成及系統(tǒng)發(fā)育組成方面，系統(tǒng)發(fā)育信號存在較大差異。其中，系統(tǒng)發(fā)育距離相近的鳥類（尤其是食果鳥類）傾向于與具有相似物種組成和系統(tǒng)發(fā)育組成的植物互作，而這一模式在植物中并不明顯。研究還發(fā)現(xiàn)，系統(tǒng)發(fā)育專性的食果鳥類往往也是互作專性物種，即它們傾向于與少數(shù)系統(tǒng)發(fā)育距離更近的植物物種互作。這種模式在傳粉鳥類以及結(jié)果植物和開花植物中均未觀察到，揭示了不同互作系統(tǒng)中生態(tài)?；呗缘牟町?。

空氣eDNA揭示果實資源對食果動物分布的影響

布起著重要的驅(qū)動作用。相比之下，食肉動物的分布與果實資源并無明顯關(guān)聯(lián)。 這一發(fā)現(xiàn)不僅為“食物資源驅(qū)動物種分布”的經(jīng)典生態(tài)學假說提供了新的實證支持，也展示了空氣eDNA在揭示生態(tài)過程方面的巨大潛力。以往的動植物關(guān)系研究大多依賴長期野外觀測，往往耗時費力，且受制于樣本規(guī)模和物種覆蓋范圍的局限。而空氣eDNA技術(shù)則能夠在短時間內(nèi)、跨大范圍同時捕捉多類群動物的分布信息，有效突破了傳統(tǒng)方法的限制。該研究表明，空氣eDNA不僅是一種高效的生物多樣性監(jiān)測工具，更能捕捉動植物互作的精細格局，為深入理解生態(tài)過程和生態(tài)系統(tǒng)運作機制開辟了全新途徑。

DNA條形碼揭示中國梧桐屬植物隱存多樣性，為其提供“分子身份證”

研究取得三項重要發(fā)現(xiàn)：一是明確核核糖體內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)（nrITS）為梧桐屬物種鑒定的“最優(yōu)條形碼”，其物種鑒定率高達91.7%（11/12類群），可精準鑒定所有10個中國已知分布的梧桐屬物種，解決了長期以來該屬物種形態(tài)鑒別困難的問題；二是在極小種群物種“云南梧桐（F. major）”中發(fā)現(xiàn)2個隱存譜系（Firmiana sp.1 和 Firmiana sp.2），其中Firmiana sp.1為高達10米的栽培喬木（主要分布于云南中部古寺廟及植物園），F(xiàn)irmiana sp.2為分布于金沙江中下游的灌叢或小喬木，二者在遺傳距離、地理分布及生長習性上均與典型的云南梧桐（位于金沙江上游）存在顯著差異，提示需重新界定云南梧桐的物種邊界；三是通過整合分析GenBank 數(shù)據(jù)庫中48條梧桐屬葉綠體基因組數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)2個樣本被錯誤標定的案例，強調(diào)了DNA條形碼在檢驗網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫中數(shù)據(jù)準確性的重要性。

云南省發(fā)現(xiàn)三種黃檀屬中國新記錄

盡管黃檀屬是一個自然的類群，但由于種間形態(tài)差異細微、喬木類群標本不足等原因，其種間分類一直存在諸多困難，有待進一步的調(diào)查研究。該研究提供了詳細的形態(tài)描述，提煉出了穩(wěn)定、可靠的鑒別特征，并重新編寫了我國黃檀組的物種分類檢索表，增加了我國黃檀屬的新成員。

城市擴張過程中生態(tài)與經(jīng)濟效益的多尺度權(quán)衡與協(xié)同

鑒于此，該研究建議，城市可持續(xù)發(fā)展須采取統(tǒng)籌的頂層規(guī)劃與設(shè)計，采取因地制宜的差異化策略。例如，在產(chǎn)業(yè)和人口密集區(qū)，優(yōu)先推進綠色基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)，增加生態(tài)綠色空間，推動多功能社區(qū)建設(shè)，恢復并提升生態(tài)系統(tǒng)服務功能；在自然植被良好區(qū)域，繼續(xù)加強森林和草地的撫育和提質(zhì)增效，探索因地制宜的生態(tài)產(chǎn)品價值實現(xiàn)創(chuàng)新機制，實現(xiàn)生態(tài)保護與經(jīng)濟發(fā)展的雙贏。同時，區(qū)域規(guī)劃應結(jié)合多層級治理機制，通過區(qū)域政策與地方實踐的有機結(jié)合與試點，促進經(jīng)濟效益與生態(tài)效益的協(xié)同發(fā)展。

PD封面|一場由東亞夏季風主導的進化：黃杞屬基因組的適應密碼

基因家族富集分析進一步揭示了常綠與落葉類群在功能上的顯著分化。常綠類群擴張的基因主要富集于光合作用、激素信號轉(zhuǎn)導及氧化還原過程等路徑，反映其對濕潤、低光、高競爭環(huán)境的長期適應；而落葉類群中擴張的基因則顯著富集于ABA信號通路、次生代謝和防御反應相關(guān)路徑，強化了其對干旱脅迫的快速響應機制。該結(jié)果表明常綠與落葉生態(tài)策略的形成不僅體現(xiàn)在譜系分化與基因組結(jié)構(gòu)上，也深刻嵌入于基因功能的選擇性擴增之中。進一步分析發(fā)現(xiàn)，常綠物種E. fenzelii在基因組功能上展現(xiàn)出顯著的適應性優(yōu)勢。

中南半島與馬來群島植物分布格局成因研究取得新進展

結(jié)果顯示：（1）輪葉三棱櫟起源于北巽他古陸，并在漸新世-中新世期間逐漸擴散至中國云南和海南，以及馬來群島的其他區(qū)域。（2）由于巽他古陸海侵海退影響，馬來群島群體經(jīng)歷了嚴重的歷史瓶頸造成了長期低遺傳多樣性;相比之下，中南半島的地形異質(zhì)性和居群間的基因流維持了居群高遺傳多樣性。（3）自末次盛冰期以來，婆羅洲始終具備適宜輪葉三棱櫟生存的環(huán)境條件，預計在未來氣候變化背景下仍將繼續(xù)發(fā)揮“避難所”的作用，為維持物種進化潛力的長期避難所應注意優(yōu)先保護。該研究闡明了古地理過程和環(huán)境因素如何共同塑造了東南亞當前的植物分布格局，并通過物種水平的種群歷史為理解區(qū)域生物地理動態(tài)提供了一個案例研究

殺菌劑揭示植物微生物互作的生態(tài)效應

分析表明，使用殺菌劑顯著提高了原生植物物種的存活率，并增加了群落整體生物量；但與此同時，它會導致植物群落多樣性下降——這種效應與排除脊椎草食動物時觀察到的結(jié)果相似。出乎意料的是，盡管存活率和群落生產(chǎn)力明顯提升，但殺菌劑對植物生長并未產(chǎn)生顯著的整體影響。殺菌劑對植物生長效果的巨大差異，很可能源于不同植物物種積累病原真菌和有益真菌（如菌根）的程度存在差異。此外，商用殺菌劑針對不同真菌類群的特異性各不相同，這也可能影響實驗結(jié)果。盡管樣本量有限，但外來物種對殺菌劑的反應較弱，這與"這些植物受本地真菌病原體壓力較小"的假設(shè)相一致。研究結(jié)果并未支持緯度生物相互作用假說（LBIH）?？傮w而言，這項研究強調(diào)了真菌病原體在維持自然植物群落多樣性方面的重要作用。使用殺菌劑后觀察到的個體存活率和群落生物量提升表明，平均而言病原真菌對植物的抑制作用遠超共生真菌帶來的益處。

JSE封面|東亞亞熱帶常綠闊葉林的演化

盡管目前對東亞亞熱帶常綠闊葉林優(yōu)勢樹種已有較多研究，但伴生樹種和草本植物的動態(tài)變化同樣值得關(guān)注，這將有助于全面揭示東亞亞熱帶常綠闊葉林的生態(tài)系統(tǒng)演變規(guī)律。該綜述整合了當前東亞亞熱帶常綠闊葉林演化研究的前沿認知，并提出應對人類世背景下的挑戰(zhàn)和研究建議。

葉片泡狀細胞驅(qū)動葉片快速卷曲調(diào)控竹類植物的水分平衡

該研究首次揭示泡狀細胞結(jié)構(gòu)與葉片保水能力在竹類植物干旱響應過程中的協(xié)同作用，為竹類抗旱育種提供了研究靶點。未來需進一步探索泡狀細胞形態(tài)變化與水分運輸?shù)姆肿訖C制，以更精準預測氣候變化下竹類生態(tài)系統(tǒng)的韌性。

植物水力特性差異驅(qū)動樹干液流方法對于植物蒸騰估算的準確性

結(jié)果表明，（1）多數(shù)物種的重新校準模型參數(shù)與Granier經(jīng)典參數(shù)顯著不同，尤其是高導水性的環(huán)孔材與藤本，其蒸騰低估程度尤為突出。（2）不同的統(tǒng)計模型、參數(shù)校準過程中所施加最大壓力等對于矯正的模型參數(shù)具有不同程度影響。值得注意的是，植物的水力特性，例如木質(zhì)部比導率，木質(zhì)部導管腔面積占比對于種內(nèi)和種間模型參數(shù)的變異具有較高的解釋率，木質(zhì)部比導率對于兩項參數(shù)的解釋率分別達到了90%和79%，這為未知物種模型參數(shù)的快速估算提供了可靠依據(jù)，將大大減少繁瑣的參數(shù)校正工作。（3）為驗證上述結(jié)論，研究團隊將重新校準參數(shù)與Granier經(jīng)典模型應用于橡膠種植園蒸騰量估算，全面評估了不同影響因素及其權(quán)重。結(jié)果顯示，Granier模型嚴重低估林分蒸騰量，而新校準參數(shù)估算結(jié)果更為合理。此外，樹液邊材面積及徑向變化、方位等尺度的非生理因素對蒸騰估算具有顯著影響。

邊界梯度特征助力高黎貢山跨境優(yōu)先保護與廊道規(guī)劃

針對高黎貢山跨境區(qū)域的生物多樣性保護需求，基于“昆明-蒙特利爾全球生物多樣性框架”行動目標3，提出了一個整合受威脅物種、關(guān)鍵生態(tài)系統(tǒng)服務、生態(tài)邊界梯度及生態(tài)連通性的優(yōu)先保護框架。研究結(jié)果顯示：高黎貢山跨境區(qū)域多維度的保護熱點，在當前保護區(qū)的覆蓋率約為20%，主要位于北部和中部。多目標協(xié)同的保護熱點區(qū)域存在明顯的保護空缺，主要分布在中部和南部。受威脅動、植物物種豐富度雖呈現(xiàn)空間正相關(guān)，但其熱點區(qū)存在一定的空間錯配。受威脅物種豐富度與碳儲存、土壤保持呈現(xiàn)空間正相關(guān)。受威脅物種保護熱點的成效，隨跨境邊界距離增加而降低，線性擬合呈顯著的負效應梯度關(guān)系（植物R2=0.95，動物R2=0.59）

云南黃杞復合群研究揭示印緬地區(qū)三級階梯地理格局

選擇東南亞典型特征植物類群胡桃科（Juglandaceae）黃杞屬（Engelhardia）的云南黃杞復合群（Engelhardia spicata complex）作為研究對象。在印緬地區(qū)以及中國南方采集了80個種群共778份復合體樣本，覆蓋了橫斷山脈、云貴高原、撣邦高原、長山山脈等關(guān)鍵地理單元。綜合利用五個葉綠體基因片段和一個核基因片段進行了系統(tǒng)發(fā)育重建、分化時間估算、祖先區(qū)域重建，以及海拔分化分析。研究發(fā)現(xiàn)，云南黃杞復合群的分化呈現(xiàn)出明顯的階段性特征：約26.62百萬年前（Ma），該復合體首次分化為兩個譜系，一個分布于低海拔的長山山脈南部，另一個則分布在橫斷山脈及撣邦高原；到了約23.03Ma時，分布于橫斷山脈及撣邦高原的譜系進一步分化，形成兩個新的譜系，其中一個位于中海拔的撣邦高原，另一個則位于高海拔的橫斷山脈和云貴高原。

稀有phoD細菌調(diào)控喀斯特果藥間作系統(tǒng)的磷生物有效性

以廣西漓江流域喀斯特果藥間作系統(tǒng)為研究對象，探討了土壤磷生物有效性的變化規(guī)律及其微生物調(diào)控機制。研究發(fā)現(xiàn)：1）與單作果園（Prunus salicina）相比，果藥間作系統(tǒng)總體上降低了土壤生物有效磷組分含量（除CaCl2-P外），但增加了微生物生物量磷含量，潛在地提高了有機磷的臨時儲存。這些變化促進藥用植物從根際土壤中吸收無機磷，表現(xiàn)在磷素活化、供應能力和獲取策略的積極響應。2）果藥間作系統(tǒng)顯著改變了phoD細菌群落的組成和結(jié)構(gòu)，但對其多樣性無影響。同時，稀有phoD類群（如假單胞菌Pseudomonas）對土壤氮磷比、pH和水分的變化更為敏感，成為調(diào)控磷生物有效性的關(guān)鍵；而豐富類群（如慢生根瘤菌Bradyrhizobium）作用較弱。3）果藥間作系統(tǒng)通過藥用植物特異性影響稀有phoD細菌，將土壤磷利用策略從“無機磷獲取”轉(zhuǎn)向“有機磷暫存”，提高了磷素利用效率；其中，李樹+金絲桃（Hypericum monogynum）和李樹+黃花倒水蓮（Polygala fallax）間作系統(tǒng)表現(xiàn)較優(yōu)。這些發(fā)現(xiàn)強調(diào)了藥用植物選擇對優(yōu)化喀斯特土壤磷循環(huán)的重要性，并表明在果藥間作系統(tǒng)中定向施磷可以提高喀斯特土地生產(chǎn)力。建議后續(xù)研究應結(jié)合不同藥用植物根系功能特征和優(yōu)化磷肥施用策略來探究根際磷循環(huán)的動態(tài)機制，以實現(xiàn)果藥間作系統(tǒng)的可持續(xù)管理。

版納植物園兩篇論文入選The Plant Cell期刊“里程碑論文”

近日，中國科學院西雙版納熱帶植物園（以下簡稱“版納植物園”）科研團隊發(fā)表的兩篇研究論文分別入選國際權(quán)威期刊The Plant Cell 2013年度和2023年度“里程碑論文”（Landmaker Papers），成為該期刊本世紀初前25年（2000-2024年）最具影響力的25項研究之一。

植物激素茉莉酸調(diào)控種子大小的新機制

蛋白質(zhì)相互作用實驗表明，JA信號途徑的關(guān)鍵抑制子JAZ直接與KLU基因的上游調(diào)控因子SOD7及其同源蛋白DPA4相結(jié)合。遺傳學分析進一步確認，SOD7高表達能抑制coi1突變體的種子大小表型。有趣的是，SOD7還能與JA途徑的核心轉(zhuǎn)錄因子MYC2和MYC4相互作用。遺傳分析和生化機制研究表明，SOD7和MYC2能相互增強彼此的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)功能，協(xié)同抑制下游KLU基因的轉(zhuǎn)錄，從而共同抑制種子大小。相反，JAZ蛋白抑制SOD7和MYC2的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)功能，且與SOD7競爭性結(jié)合MYC2。值得注意的是，JA信號對于SOD7–KLU途徑及種子大小的調(diào)控，在高鹽脅迫條件下也發(fā)揮關(guān)鍵作用。此外，SOD7還能與ABI5轉(zhuǎn)錄因子相互作用，暗示其可能參與種子從發(fā)育到萌發(fā)的全過程調(diào)控。